Fundação Regional Faculdade de Medicina – Funfarme foi fundada em 12 de junho de 1967 com o nome de Fundação Regional de Ensino Superior da Araraquarense – FRESA para ser a mantenedora da Faculdade Regional de Medicina – FARME, atual FAMERP e do Hospital de Base – HB. A partir de 1979, a FRESA passou a denominar-se FUNFARME, funcionando sob a supervisão de um Conselho de Curadores que tem a incumbência de eleger a diretoria que administração a fundação. Até antes da estadualização, o diretor da FUNFARME respondia pela direção do Hospital de Base e da faculdade. Com a estadualização, a FUNFARME administra o Hospital de Base, o Hemocentro, a Rede de Reabilitação Lucy Montoro e o Hospital e Maternidade da Criança – HCM. A faculdade, sob a denominação de FAMERP é dirigida por um diretor escolhido em lista tríplice eleita pela comunidade universitária e submetida à escolha do governador do Estado. Entre os presidentes do Conselho Curador estão Telmo Maia de 1979 a 1981, Accácio de Oliveira Santos Júnior de 1981 a 1981, Aldemir Bilaqui em 1983 a 1984, Aldônio Ferreira de Faria Júnior em 1985, Daniel Ferreira de Freitas de 1985 a 1987, Jorge Kahuam em 1987 e de 1989 a 1991, Rodolfo Luiz Tadei Barbosa em 1988, Eduardo Nicolau em 1989, Nicanor Batista Júnior em 1992, Germano Hernandes Filho de 1993 a 1994, Fernando Araújo em 1995 e Mário Abbud Filho em 1996.
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