Inaugurado em 28 de agosto de 1947, como Ginásio São José, foi fundado pelos padres agostinianos no distrito de Engenheiro Schmitt. O ginásio foi instalado em Schmitt a pedido do médico Coutinho Cavalcanti, amigo do padre agostiniano Vito Fernandez, da Ordem dos Agostinianos. A pedra fundamental foi lançada em 20 de janeiro de 1935, quando o distrito era um povoado em franco desenvolvimento econômico, com a presença do bispo D. Lafayette Libânio. Inaugurado, o ginásio iniciou suas atividades com internato, semi-internato e externato, oferecendo primário (1º e 4º anos), admissão e 1º ano ginasial, sob a direção do padre Miguel Lanero e inspetoria de Oscar de Barros Serra Dória.
Dez anos após a inauguração em Schmitt, era feito o lançamento da pedra fundamental para a construção de um novo prédio, desta vez em São José do Rio Preto, no Jardim Santa Catarina, um bairro novo da cidade, na rua dos Agostinianos, 88. Eram 9h30 do dia 24 de novebro de 1957, quando o bispo D. Lafayette Libânio, após celebrar uma missa campal, fez a benção da pedra fundamental, com a presença do prefeito Alberto Andaló. Os engenheiros Elbio Camilo e Francisco Camillo, responsáveis pelo projeto, também estiveram presentes. O terreno foi doado por Mançor Daud. O novo prédio foi inaugurado em 19 de março de 1961, sob a direção do padre Carlos Beltran Ayuso.
Foram diretores Miguel Lanero de 1947 a 1948, Miguel Revilla Valbuena de 1949 a 1954, Lourenço Macho Liebana de 1955 a 1957, Mariano de la Mata de 1958 a 1960, Carlos Beltran Ayuso em 1961, Clemente Marton Segura em 1962, Pablo Luna Garcia em 1963, Eustásio Fernandez Santos em 1964 e em 1966, Benito Gomes 1965, Isaias Alonso Fernandez de 1967 a 1973, Isidoro Calvo Martin de 1974 a 1979, João Xavier de 1980 a 81, Luís Miguel Cuadrado Gutierrez de 1982 a 1985 e de 1994 a 1997, Pelayo Moreno Palácios de 1986 a 93 e Abelardo Benito Rica de 1998 a 2001, Jorge Luís Arias Alvarez de 2001 a 2006, Agustín Alcalde de Arriba a partir de 2007.
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